洪武十五年(1382)正月一日，在谨身殿大宴群臣，开始用九奏乐。景川侯曹震、定远侯王弼攻下威楚路。二日，元曲靖宣慰司以及中庆、澄江、武定各路全部投降，云南于是平定。九日，减少死罪囚犯。十五日，在南郊隆重祭祀天地。二月二日，命令天下朝觐官各举荐一人。四日，黄河在河南决口，驸马都尉李祺受命赈饥。六日，诏谕天下：云南已经平定。闰二月二十三日，蓝玉、沐英攻克大理，接着分兵巡回鹤庆、丽江、金齿，各地俱下。三月二十一日，黄河在朝邑决口。

四月五日，将元朝梁王把匝剌瓦儿密及威顺王的儿子伯伯的家属迁到耽罗。七日，诏谕天下一律祭祀孔子。十日，免除京畿、浙江、江西、河南、山东的税粮。五月十七日，建成太学，隆重祭祀先师孔子。二十八日，广平府官吏王允道奏请发展磁州冶铁业。朱元璋说“：我只听说当帝王的人要使天下没有遗漏的贤人，而没有听说要使天下没有遗漏的利益。现在，兵器不缺，而且民众安定，此事对国家无益，只能骚扰人民。”将王允道施杖刑后，流放岭南。二十九日，派遣行人探访贤哲之士。

七月八日，黄河在荥泽、阳武决口。十二日，罢免了四个辅官。八月一日，傅友德、沐英击败乌撒蛮。三日，恢复科举，三年一次，作为制度。十二日，皇后死去。十五日延安侯唐胜宗、长兴侯耿炳文在陕西屯田。二十三日，提升秀才曾泰为兵部尚书。二十七日，告示天下选拔秀才要分六科考试。九月三日，吏部将郑韬等三千七百多贤哲之士引见给皇帝，并令他们举荐所知人才，立即派人征召。赏赐郑韬等人钱钞，不久又分别授予布政使、参政等不同的官职。二十四日，将孝慈皇后葬在孝陵。

十月一日，设置都察院。二十一日，审查囚犯罪状。十一月十三日，徐达还京。当月，平定广东群盗，诏赵庸撤军。二十六日，设置殿阁大学士，让邵质、吴伯宗、宋讷、吴沉担任。十二月十七日，赈济北平受灾的屯田士兵。二十五日，永城侯薛显料理山西军务。

这一年有爪哇、琉球、乌斯藏、占城前来朝贡。

洪武十六年(1383)正月十一日，在南郊隆重祭祀天地。十四日，徐达镇守北平。二月二十二日，要天下各学校每年要向京师输送人才。三月一日，召南征军队回师，沐英留守云南。二十三日，返还凤阳、临淮两县百姓的徭赋，以后世代不贡。

五月十七日，免除京畿各府的田租。六月十九日，免除京畿十二州县养马人户的田租一年，免除滁州养马户田租二年。

七月，派遣御史审查囚犯罪状。八月一日，日食。九月二十三日，申国公邓镇被封为征南将军，讨伐龙泉山贼寇，并予以平定。

十月七日，召回徐达。十二月二十五日刑部尚书开济犯罪被杀。

这一年，琉球、占城、西番、打箭炉、暹罗、须文达那前来朝贡。

洪武十七年(1384)一月九日，在南郊隆重祭祀天地。十日，徐达镇守北平。二十四日，汤和巡视沿海诸城，防御倭寇。三月一日，颁布科举考试的格式。曹国公李文忠死去。二十七日，大赦天下。

四月十五日，对平定云南的将士论功，封傅友德颍国公，陈桓等四人为侯，大赏将士。十八日，收殓阵亡将士遗骸。扩建国子学学舍。五月二十九日，凉州指挥宋成讨伐西番，在亦集乃将其击败。

七月二日，禁止内官干预国事，并传文告示各司不准与内官交往。十七日，诏谕百官，有迎接养父母的，官府供给车船。二十一日，免除京畿内当年的一半田租。二十四日，审查囚犯罪状。二十六日，有一个盱眙人进献天书，被斩首。八月一日，黄河在开封决口。七日，杞县黄河决口，派遣官吏堵塞大堤。二十四日，免除河南诸省拖欠的赋税。

十月十二日，河南、北平发生水灾，派遣驸马都尉李祺等人整治。闰十月十九日，告示对天下囚犯，必须由刑部、都察院详细审查，由大理寺反复审判后上奏判决。当月，召回徐达。十二月十九日，免除云南拖欠的赋税。

这一年，琉球、暹罗、安南、占城前来朝贡。

洪武十八年(1385)正月初九，在南郊隆重祭祀天地。十一日，对朝觐官分成五等进行考查，罢黜升迁各有不同。二月十二日，由于连连阴雨、打雷下冰雹，要臣民帮助检举过失。二十七日，魏国公徐达死去。三月十一日，赐给丁显等人进士及第以及其他不同的出身。诏谕国内外官员之父母死在其任职之地，有司供给车船送回安葬，并定为制度。十四日，免除京畿内当年田租。命天下各郡县埋葬暴露在外的尸骨。十五日，初次选出的进士担任翰林院、承敕监、六科庶吉士。二十八日，户部侍郎郭桓坐盗官粮，被诛杀。

四月六日，吏部尚书余火气犯罪被诛。二十五日。思州蛮叛乱，汤和被封征虏将军，周德兴担任副将军，率兵跟随楚王朱桢讨伐叛军。六月十八日，规定外地官员三年进京朝见一次，并定为制度。

七月十四日，封王礻禺为高丽国王。二十日，五开蛮反叛。八月二十一日，冯胜、傅友德、蓝玉在北平四周守备。当月，赈济河南水灾。

十月一日，发布《大诰》。十五日，召回冯胜。十六日，下诏书说：“孟子传道，功绩卓著。经过了这么多年，其子孙后代甚少。近来有一些以罪输作者，岂是尊敬先贤的道理。必须着意探访，凡是圣贤的后代输作，皆释免。”当月，楚王朱桢、信国公汤和平定了五开蛮叛乱。十一月十七日，免除河南、山东、北平的田租。十二月十九日，下诏要有司举荐孝廉。二十六日，麓川平缅宣慰使思伦发反叛，都督冯诚被打败，千户王升战死。

这一年，有高丽、琉球、安南、暹罗前来朝贡。

洪武十九年(1386)正月四日，赈济大名以及江浦的水灾。七日，在南郊隆重祭祀天地。当月，征蛮军队回师。二月十日，耕耘耒昔田。二十七日，赈济河南饥荒。

四月十九日，诏令赎下河南贫苦人家所卖的子女。六月二十日，诏令有司抚恤慰问年纪大的人。贫民年纪在八十以上，每月给五斗米、三斤酒、五斤肉；九十岁以上的，每年加帛一匹，棉花一斤；有田产的人不给米。应天、凤阳的富裕人，八十岁以上赐封爵社士，九十岁以上封为乡士；其他地方富民八十岁以上为里士，九十岁以上为社士。都与县官同礼，免除全家徭役。鳏寡孤独不能生活的，一年给米六石。士兵在战场上负伤的，免除兵役以及三年徭役。军官阵亡，其子世袭并加一级俸禄，对隐居之士，以礼相聘。二十三日，赈济青州和郑州的饥荒。

七月二十九日，诏令举荐各种人才。六十岁以上的，担任翰林院顾问；六十岁以下的，在六部、布按二司任职。三十日，命皇太子在泗州、盱眙修建祖陵，将德祖以后皇后的衣冠葬于此陵。九月七日，在云南屯田。

十月，诏令给子女幼年或父母年老的已亡官兵照发全部俸禄。并定为制度。十二月一日，有日食。当月，命令宋国公冯胜派兵防御边疆。派遣河南、北平、山东、山西百姓往大宁运粮。

这一年，有高丽、琉球、暹罗、占城、安南前来朝贡。

洪武二十年(1387)一月二日，冯胜被封为征虏大将军，傅友德、蓝玉为副将军，率兵征伐纳哈出。焚毁锦衣卫刑具，将囚犯押往刑部。十三日，在南郊隆重祭祀天地。祭祀结束，天气转好。侍臣赞美说“：这是陛下诚心敬天所至。”朱元璋说“：所谓敬天，不仅要有庄敬、有礼之形式，还要实际的东西。天将管理子民的大任交给君王，为君的，若想侍奉上天，必须首先体恤万民。体恤万民，才是事天之实。就像国家派去担任太守县令等官的人一样，若不能造福于民，则未完成君王交给的使命，这是大不敬啊。”又说“：为万民之君的人，天为父，地为母，民为子，应尽各种职责，祭祀天地，并非为自己祈福，而是为了天下万民。”二月一日，观看军队操练。十四日，耕耘耒昔田。三月一日，冯胜率兵出松亭关，攻克大宁、宽河、会州、富峪。

四月八日，江夏侯周德兴在福建沿海修筑城防，抵御倭寇。六月二十二日，临江侯陈镛率军出征，迷失方向，全军覆没。二十五日，冯胜率兵越过金山。二十九日，纳哈出投降。闰六月十二日，回师停留金山，都督濮英率兵殿后，遇到伏击，战死。

八月二十六日，没收冯胜将军印，并将其召回，蓝玉主管军中事务。景川侯曹震在云南品甸屯田。九月一日，封纳哈出为海西侯。六日，设置大宁都指挥使司。二十日，安置郑国公常茂于龙州。三十日，封蓝玉为征虏大将军，延安侯唐胜宗、武定侯郭英为副将军，北征沙漠。当月，攻克西宁。

十月一日，封朱寿为舳舻侯，张赫为航海侯。当月，将冯胜罢免送回凤阳，奉诏才去朝见。十一月六日，普定侯陈桓、靖宁侯叶升在定边、姚安、毕节各卫屯田。八日，汤和返回，共筑宁海、临山等五十九处城防。十二月，赈济登、莱饥荒。

这一年有琉球、安南、高丽、占城、真腊、朵甘、乌斯藏前来朝贡。

洪武二十一年(1388)正月六日，麓川蛮思伦发进攻马龙他郎甸，都督宁正将其击败。十六日，在南郊隆重祭祀天地。十九日，赈济青州饥荒，逮捕惩治有司中隐匿上报饥灾文书的人。三月一日，封赐任亨泰等进士及第以不同的出身。十二日，赈济东昌饥荒。三十日，沐英讨伐思伦发，将其击败。

四月十二日，蓝玉打败元嗣君王于捕鱼儿海，俘获其次子地保奴及妃主王公以下几万人后返回。五月一日，日食。六月二日，信国公汤和回归凤阳。二十二日，封傅友德为征南将军，沐英、陈桓为左、右副将军，率兵讨伐东山叛蛮。

七月六日，将地保奴安置到琉球。八月十二日，将泽、潞无业百姓迁至黄河两边开垦土地，赏给钱钞，为其发放农具，免赋税三年。二十六日，蓝玉回师，对北征将士大加赏赐。二十七日，封孙恪为全宁侯。当月，皇帝亲自制定八谕告诫武臣。九月十五日，秦、晋、燕、周、楚、齐、湘、鲁、潭九王来京朝拜。二十二日，越州蛮阿资叛乱，沐英与傅友德同往讨伐。

十月七日，东川蛮被平定。二十四年升封蓝玉为凉国公。

这一年有高丽、占城、琉球、暹罗、真腊、撒马儿罕、安南前来朝贡。下诏要安南三年朝贡一次，像犀之类的东西不要进献。安南黎季睺杀掉其主炜。

洪武二十二年(1389)正月十六日，将大宗正院改为宗人府，让秦王朱..担任宗人令，晋王朱木罔、燕王朱棣为左、右宗正，周王朱木肃、楚王朱桢为左、右宗人。十七日，在南郊隆重祭祀天地。二十五日，傅友德在普安击破阿资。二月二十日，蓝玉在四川练兵。二十三日，禁止武臣参与地方事务。二十四日，湖广千户夏得忠勾结九溪蛮叛乱，靖宁侯叶升平定叛乱，夏得忠伏诛。当月，阿资投降。三月一日，傅友德率诸将驻扎四川、湖广，防御西南蛮。

四月一日，迁徙江南人到淮南，发给钱钞和农具，免征三年赋税。五月十五日，魏国公徐允恭、开国公常开等在湖广练兵。十六日，将元降王迁至眈罗。当月，派御史审查山东隐匿灾情不报的官吏。五月二十三日，在兀良哈设置泰宁、朵颜、福馀三卫。

七月，傅友德等返回。八月二十日，诏令全国推荐德高望重又洞悉时务的长者。当月，更定大明律。九月一日，日食。

十一月二日，宣德侯金镇等在湖广练兵。十五日，思伦发朝贡谢罪，于是麓川平定。十二月十日，周王朱木肃犯罪，迁云南，不久免迁，仍留居京师。定远侯王弼等在山东、河南、陕西练兵。

这一年有高丽、安南、占城、暹罗、真腊前来朝贡。元也速迭儿杀其君主脱古思帖木儿另立坤帖木儿。高丽废君主礻禺，接着又废君主昌。安南黎季睺杀害其主日火昆。

洪武二十三年(1390)一月三日，晋王木冈、燕王棣率兵征讨元朝丞相咬住、太尉乃儿不花，征虏前将军颍国公傅友德等皆听其节制。十五日，在南郊隆重祭祀天地。十六日，贵州蛮叛乱，延安侯唐胜宗平定叛乱。六日，齐王..率兵跟随燕王棣北征。赣州贼寇作乱，东川侯胡海担任总兵官，普定侯陈桓、靖宁侯叶升为副将，将其平定。唐胜宗督促贵州各卫屯田。二月十四日，蓝玉平定西番蛮的叛乱。二十二日，耕种耒昔田。二十九日，黄河在归德决口，发动各地军民堵塞。三月三十日，燕王军队停留迤都，咬住等人投降。

四月，吉安侯陆仲亨等人被胡惟庸一案连坐下狱。三日，潭王梓自焚而死。闰四月十四日，蓝玉平定施南、忠建蛮的叛乱。五月二日，将各公侯遣回故里，分别赏赐金钱。二十三日，将太师韩国公李善长赐死，陆仲亨等人连坐被杀。作《昭示奸党录》，并公告天下。六月四日，蓝玉派凤翔侯张龙平定都匀、散毛诸蛮。二十九日，给有才德、知典故的老人授官。

七月二日，黄河在开封决口，进行整治。三日，崇明、海门风雨成灾，海潮泛滥，派遣官吏治理，并征集二十五万民工筑堤。八月十三日，诏令禁止以官吏、兵士充当选举。蓝玉返回。当月，赈济河南、北平、山东水灾。九月一日，日食。

十月二十一日，赈济湖广饥荒。十一月二十五日，免除山东受灾之地的田租。规定凡是斩首以下的囚犯到北方边疆种植，交粟赎罪。十二月五日，停止天下织造文绮。

这一年，墨剌、哈梅里、高丽、占城、真腊、琉球、暹罗前来朝贡。

洪武二十四年(1391)正月十五日，在南郊隆重祭祀天地。二十日，颍国公傅友德被封为征虏大将军，定远侯王弼、武定侯郭英为副将军，守备北平四周。二月十五日，免去山东田租。二十九日，耕种耒昔田。三月一日，日食。魏国公徐辉祖、曹国公李景隆、凉国公蓝玉守备陕西边疆。八日，靖宁侯叶升在甘肃练兵。十日，封赐许观等人以进士及第等不同出身。

四月十四日，封皇子朱木旃为庆王，朱权为宁王，朱木便为岷王，朱木惠为谷王，朱松为韩王，朱模为沈王，朱楹为安王，朱逪为唐王，朱栋为郢王，朱木彝为伊王。二十六日，燕王朱棣率傅友德诸将出塞，败敌而归。五月十二日，汉、卫、谷、庆、宁、岷六位王公在临清练兵。六月四日，诏令廷臣参考历代礼典制度，修改、制定冠服、居室、器用等方面的制度。九日，长时间干旱。审查囚犯罪状。

七月十五日，将一些富民迁到京师，以充实都城。十六日，免除京畿内官员的一半田租。八月一日，秦王朱..犯罪，召回京师。九月九日，皇太子巡抚陕西。十一日，都督佥事刘真、宋晟讨伐哈梅里，将其击败。二十一日，派人出使西域。当月，倭贼攻打雷州，百户李玉、镇抚陶鼎战死。

十月四日，免除北平、河间遭受水灾地方的田租。十一月十二日，五开蛮叛乱，都督佥事茅鼎平定叛乱。二十八日，皇太子返回京师，晋王木罔前来朝见。二十九日，赈济河南水灾。十二月十八日，周王木肃返回封地。二十九日，阿资又反，都督佥事何福讨伐，降服了阿资。

这一年，天下郡县赋役黄册编成，共计一千零六十八万四千四百三十五户，五千六百七十七万四千五百六十一人。琉球、暹罗、别失八里、撒马儿罕前来朝贡。占城因有篡位之事，拒受其朝贡。

洪武二十五年(1392)一月六日，周王朱木肃前来朝见。二月八日，黄河在阳武决口，征集军民堵塞，免除受水灾之地的田租。十三日，在南郊隆重祭祀天地。何福平定都匀、毕节诸蛮。十九日，规定死囚，纳粟到塞下赎罪。二十日，晋王朱木罔，燕王朱棣、楚王朱桢、湘王朱柏前来朝见。二月七日，召曹国公李景隆等人返回京师。靖宁侯叶升等人在河南及临、巩、甘、凉、延庆练兵。都督茅鼎等人平定五开蛮。十五日，耕种耒昔田。二十九日，诏令天下卫所军队抽出十分之七屯田。三月二日，冯胜等十四人分别料理陕西、山西，河南诸卫军务，三月九日，改封豫王朱桂为代王，汉王朱木英为肃王，卫王朱植为辽王。

四月一日，凉国公蓝玉出征罕东。二日，建昌卫指挥月鲁帖木儿叛乱，被指挥鲁毅击败。二十五日，皇太子朱标死去。二十七日，都督聂纬、徐司马、瞿能讨伐月鲁帖木儿，等蓝玉返回，一并受其节制。五月一日，蓝玉到达罕东，叛军逃跑，于是趋兵建昌。九日，赈济陈州、原武水灾。六月十日，西平侯沐英死于云南。

七月一日，秦王朱..返回封地。四日，指挥瞿能在双狼寨打败月鲁帖木儿。八月十日，江夏侯周德兴连坐被诛。十八日，冯胜、傅友德率领开国公常升等分行山西，籍民为军。在大同、东胜屯田，建立了十六卫。二十五日，供给王公诸侯每年的俸禄，归赐田地于官。二十七日，靖宁侯叶升连坐胡惟庸一案被诛。九月十二日，册立皇孙允火文为皇太孙。高丽李成桂囚禁其主瑶而自立为王，借国人之名上表请命，诏令允奏，改其国号为朝鲜。

十月二十七日，沐春承袭封号西平侯，镇守云南。十一月十七日，蓝玉擒获月鲁帖木儿，处死，召回蓝玉。十二月二十八日，宋国公冯胜、颍国公傅友德等人兼任东宫师保官。闰十二月二十二日，冯胜担任总兵官，傅友德为副总兵，在山西、河南练兵，兼任领屯卫。

这一年，有琉球、中山、山南、高丽、哈梅里前来朝贡。

洪武二十六年(1393)正月二日，规定天下耆民免朝。十五日，在南郊隆重祭祀天地。二月二日，晋王朱木冈统领山西、河南军队出塞，召回冯胜、傅友德、常升、王弼等人。十日，蜀王朱椿来京朝见。凉国公蓝玉因为谋反被诛，鹤庆侯张翼、普定侯陈桓、景川侯曹震、舳舻侯朱寿、东莞伯何荣、吏部尚书詹徽等都被连坐诛杀。十四日，颁发逆臣录于天下。十五日，耕种耒昔田。三月六日，代王朱桂率护卫兵出塞，受晋王节制。长兴侯耿炳文在陕西练兵。十一日，冯胜、傅友德守卫山西、北平边防，其属卫将校都受晋王、燕王节制。十五日，诏令晋、燕二王，重要军务要事先奏知。十七日，会宁侯张温连坐于蓝玉一案而被诛杀。

四月一日，孝感发生饥荒，派人开官仓、贷粮赈饥。诏谕自今以后，发生饥荒，先贷后奏，定为制度。十七日，周王朱木肃来京朝拜。十九日，天气干旱，要群臣直言其得失，审查监狱的囚犯。二十五日，由于安南擅自废立君主，拒绝接受其朝贡。

七月一日，日食。五日，选拔秀才张宗..等人跟随詹事府官到文华殿，侍候皇太孙。八月，秦、晋、燕、周、齐五王前来朝见。九月十一日，代、肃、辽、庆、宁五王来京朝拜。赦免胡惟庸、蓝玉余党。

十月二十四日，提升国子监生六十四人担任布政使等官职。十二月，给诸王颁发《永鉴录》。

这一年，琉球、爪哇、暹罗前来朝贡。

洪武二十七年(1394)正月十五日，在南郊祭祀天地。二十一日，封李景隆为平羌将军，镇守甘肃。各地开仓贷粮给贫民百姓。三月一日，封赐张信等人以进士及第和其他不同的出身。二日，魏国公徐辉祖、安陆侯吴杰在浙江防备倭寇。十一日，督促百姓种植桑、枣、木、棉。二十五日，由于四方平定，收藏兵器，表示永不复用。

八月七日，吴杰以及永定侯张铨率领辞官的武将，在广东防备倭寇。八日，派国子监生前往各地，督促官吏、百姓兴修水利。十九日，阶、文军队叛乱，都督宁正被封为平羌将军前往征讨。九月，徐辉祖节制陕西沿边各路军队。十一月二十九日，颍国公傅友德犯罪被诛。阿资又反，西平侯沐春将其击败。十二月，定远侯王弼犯罪被杀。

这一年，乌斯藏、琉球、缅、朵甘、爪哇、撒马儿罕、朝鲜来京朝贡。安南前来朝贡被拒绝。

洪武二十八年(1395)正月十日，阶、文贼寇平定，宁正率兵跟随秦王朱..征伐洮州叛番。十二日，在南郊祭祀天地。二十九日，西平侯沐春擒斩阿资，平定越州。当月，周王朱木肃、晋王朱木冈率领河南、山西各卫军队出塞，修筑城防和屯田。燕王朱棣率总兵官周兴出辽东要塞。二月三日，宋国公冯胜犯罪被杀。二十五日，诏谕户部编民以一百户为一里。遇婚丧病死以及其他困难，里中富裕的人帮助钱财，贫穷的人助力。春耕秋收，通力合作，以便百姓和睦。

六月十日，诏令各地土司都要提倡儒学。十九日，周兴等人从开原追敌到甫答迷城，没能赶到，于是返回。二十七日，皇帝在奉天门对群臣说：“我起兵到今天有四十多年了，灼见情伪，惩治奸顽，有时不按法典用刑，这不能长久。以后，只能按照法典与大诰办事，不许用黥、刺、非刂、劓、阉割等刑罚。对敢请求施酷刑的人要从重处罚。”又说“：我废除丞相，设置府、部、都察院分管各种事务，大权归于朝廷。以后的君王不准再设丞相。有为臣的胆敢请求设置，从重处罚。皇亲犯谋逆之罪，严惩不赦。我，犯法，由宗亲会议从严制裁。法司只许上奏检举，不得擅自捕人。严格制定这些典章，永世遵守。”

八月六日，封都督杨文为征南将军，指挥韩观、都督佥事宋成为副将军，讨伐龙州土官赵宗寿。七日，信国公汤和死去。二十日，赵宗寿来朝谢罪，杨文又率兵讨伐奉议、南丹叛蛮。九月六日，免除京畿、山东秋粮。十九日，向天下颁发皇明祖训条章，“后人若有谈论更改祖制的，以奸臣论处”。十一月十五日，奉议、南丹蛮都被平定。十二月三日，诏令对河南、山东栽种桑枣以及二十七年(1394)以后新开垦的土地，不要征税。

这一年，朝鲜、琉球、暹罗来京朝贡。

洪武二十九年(1396)一月十五日，在南郊祭祀天地。二月十五日，征虏前将军胡冕讨伐郴、桂蛮，予以平定。二十三日，燕王朱棣率兵巡视大宁，周世子有墩领军巡视北平关隘。三月四日，楚王朱桢、湘王朱柏入京朝见。七日，燕王朱木肃在彻彻儿山打败敌军，又追剿到兀良哈秃城后返回。

八月二十二日，免除应天、太平五府田租。九月二十日，召见辞官的武将二千五百多人，大加赏赐，并加一级俸禄。

这一年，琉球、安南、朝鲜、乌斯藏来京朝贡。

洪武三十年(1397)一月三日，封耿炳文为征西将军、郭英为副将军，巡视西北边防。十三日，在南郊祭祀天地。十四日，在山西、北平、陕西、甘肃、辽东设置流动的太仆寺，掌管马匹管事宜。十六日，左都督杨文在辽东屯田。当月，沔县盗贼起事，诏令耿炳文征讨。二月七日，水西蛮叛乱，都督佥事顾成被封为征南将军，平定反叛。三月一日，赐封陈安阝等人以进士及第等不同的出身。二十八日，古州蛮反叛，龙里千户吴得、镇抚井孚战死。

四月十七日，都指挥齐让被封为平羌将军，前往征讨。二十日，平定水西蛮。五月一日，日食。四日，楚王朱桢、湘王朱柏率兵讨伐古州蛮。六月一日，封赐礼部覆试贡士韩克忠等人以进士及第等不同的出身。二十九日，驸马都尉欧阳伦犯罪被赐死。

八月八日，黄河在开封决口。十五日，李景隆被封为征虏大将军，在河南练兵。九月一日，汉、沔贼寇被平定。十九日，麓川平缅土酋刀干孟追随宣慰使思伦发反叛。二十六日，都督杨文代替齐让担任征虏将军。

十月十日，停止辽东海运。十三日，耿炳文在陕西练兵。七日，重建国子监先师庙完工。十一月二十五日，沐春为征虏前将军，都督何福等人为将军，讨伐刀干孟。

这一年有琉球、占城、朝鲜、暹罗、乌斯藏、泥八剌入京朝贡。

洪武三十一年(1398)正月十四日，在南郊祭祀天地。十七日，派人到山东、河南督促农耕。二月八日，倭寇攻打宁海，被指挥陶铎击败。二十四日，平定古州蛮，召回杨文。二十七日，都督佥事徐凯平定么些蛮。

四月四日，廷臣以朝鲜屡生事端为由，请求讨伐，未准。五月初一日，沐春大败刀干孟。八日，皇上患病。十二日，都督杨文跟随燕王朱棣，武定侯郭英跟随辽王朱植，在开平守备，俱受燕王节制。

闰五月八日，皇上病情恶化。十日，驾崩于西宫，终年七十一岁。遗诏说：“我在位三十一年，忧心于天下，日夜操劳，以求有益于民。无奈出身寒微，无古人之博识，扬善惩恶，做得很不够。现在顺其万物自然的法则，没有必要哀念。皇太孙允火文英明仁孝，受天下拥戴，应继承皇位。内外文武大臣要齐心辅佐，以使天下安定。丧礼祭祀所需的东西，不要用金银器皿。孝陵的山水保持原貌，不要改变。天下臣民，哀悼三天之后，全部脱去孝服，以免影响嫁娶之事。诸王留在封地，不要前往京师。此诏令未说之事，按诏令意思酌情办理。”十六日，安葬于孝陵。被追封为高皇帝，庙号为太祖。永乐元年(1403)，追封为圣神文武钦明启运俊德成功统天大孝高皇帝。嘉靖十七年(1538)，进而追封为开天行道肇纪立极大圣至神仁文义武俊德成功高皇帝。

太祖皇帝有天授智勇，统一华夏，文韬武略，为汉、唐、宋各代君主所不及。开始之初，能深藏不露，静观变化，战略顺序，成算在胸。曾与各位臣僚谈论夺取天下的谋略，说：“我遭遇战乱，起事于穷乡僻壤，本来只想保全自己。到渡江以后，看群雄的所作所为，只是使百姓遭受灾难，其中张士诚、陈友谅尤为突出。士诚可凭借财富，友谅凭借强大，唯独我没有依靠。只是不喜杀人，提倡信义，厉行节俭，与各位同舟共济。起初与张、陈二寇相持，士诚与我更接近，有的人建议要先攻击他。我认为友谅性格骄狂，士诚器量窄小，性格骄狂则喜欢挑起战事，器量窄小则没有远大抱负，因此要先进攻友谅。鄱阳之战，士诚军队没有迈出姑苏一步去进行援救。如果先进攻士诚，浙西凭借牢固城防坚守，友谅必然率全部兵马赶来，我就会腹背受敌。除掉二寇，北上平定中原，之所以先攻山东，再进河洛，而停止潼关兵马不去攻取秦、陇，是因为扩廓帖木儿、李思齐、张思道虽经百余战却胜负未分，急于进攻，他们就会联合一起抵抗，短期内不能平定他们，因此，出其不意，反而率军北上。燕都既然攻克，再行西征。张、李势单力薄，于是不战而胜，然而扩廓还拼力抵抗。如果不先攻下燕都，就急于与他角逐，胜负就难说了。”太祖皇帝的雄才大略，制胜于敌，可见一斑。因此，他能平息祸乱，取得天下。有道是“后来者居上的道理”岂是偶然的吗？

评论：太祖凭聪明神武的天资，胸怀济世安民之志，审时度势，豪杰景仰，平定战乱，消除强暴，十五年完成帝业。从一介布衣到基业覆盖海宇，自西汉以后从未有过。吸取元朝政治废弛的教训，整肃政治。而且对耆儒以礼相待，考查制定礼典乐章，彰明经义，尊崇正学，施恩于亡国亡地，澄清吏治，修定做人准则，尊崇风俗宗教，正后宫名义，内治肃清，禁止宦官太监干预政事，五府六部官职互相牵制，设卫屯田，兵器粮食充足。以武平定祸乱，以文建立太平盛世，太祖一身兼有。在崇尚节义方面，允许蔡子英北归。晚年更加忧民，曾以一年的时间开挖支河数万处河渠塘堰，以利农桑，预防旱灾。凭借这些，其子孙承袭基业二百多年，士重名义，平民充实。至今后代蒙受恩泽，就如东楼、白马，世代相传祭祀太祖，享受这些决不是平白无故的啊！