六部的设置，开始于洪武元年(1368)。镇江的滕毅首任吏部长官，辅佐省台裁定铨除考课诸法略具。至此，陈修与侍郎李仁详考，参照时宜，按地之重要、偏僻，为设官烦简。凡庶司黜陟及课功核实之法，都精心筹划，铨法秩然。不久，死于官位上。其后制度多次修改。令入朝觐见的官吏各举所知，制定内外封赠荫叙之典章，从浮山李信开始。天下朝正官各造事迹文册图画土地人民献上，及拨用吏员法，自昆山余火气开始。效法《唐六典》，自五府、六部、都察院以下诸司设官分职，编辑成书，书名为《诸司职掌》，定吏役考满给由法以为司、卫、府、县首领，选拔监生中会写文章者兼任州县官及学正、教谕，自泰兴翟善开始。三年一朝，考核等第，自沂水杜泽开始。这就是洪武年间的铨政大略。
六部最初属于中书省，权势较轻，多仰承丞相的旨意。滕毅、陈修及詹同、吴琳、赵好德等人，在吏部时可以称得上贤良，但也没有大的建树。至十三年(1380)，中书省撤消，各部的权力专一，而吏部为首要。太祖执法严密，余火气因排挤宋讷而被杀，翟善被贬，杜泽被任命为尚书，没几月就被罢免。唯独李信历任侍郎，担任尚书达两年多，死于官任上。
杨思义，不知其籍贯。太祖称吴王时，授予他起居注。最初，钱谷隶属中书省。吴元年(1367)，开始设立司农卿，任用了杨思义。第二年，设置了六部，思义改任户部尚书。大乱之后，人多废业。思义请求皇上命令百姓都种植桑麻，四年后才征收税，不种桑者上缴绢，不种麻者上缴布，就如《周官》的里布法。太祖念及不时水旱，缓急没有保障。命思义令天下设立预备仓，以此来防备水旱。思义首先实施，以农桑积贮为当务之急。凡他所兴设，虽是太祖的旨意，但他经划详密，当时都称颂他能干。后调任陕西行省参政，死于官任上。
周祯，字文典，江宁人。元朝末年流亡到湖南。太祖平定武昌，任用他为江西行省佥事，历任大理卿等职。太祖认为唐、宋都有成律断狱，唯独元朝以一时行事为条格，官吏容易违法。诏令周祯与李善长、刘基、陶安、滕毅等人制定律令，少卿刘惟谦、丞周浈也参与此事。书写成后，得到太祖的称赞。
洪武元年(1368)，设置刑部，任命周祯为尚书，不久改任治书侍御史。第二年出任广东行省参政。当时省治刚开始实行，正官大多空缺，吏治不严厉。香山丞冲敬治理有政绩，积劳成疾，死于官位上，周祯作文祭奠。闻者感动。一时郡邑良吏雷州同知余骐孙、惠州知府万迪、乳源知县张安仁、清流知县李铎、揭阳县丞许德、廉州知府脱因、归善知县木寅，周祯列举他们的政绩上奏。木寅是土司。脱因是蒙古人。于是属吏益加努力。三年(1370)九月召为御史中丞。不久因病辞官。太祖初即位时，有鉴于元朝的宽纵，使用法律很严，奉行者重足立。法律制定以后，吏士开始循守。其后多次修正，都以周祯的书为依据。
杨靖，字仲宁，山阳人。洪武十八年(1385)，中进士，选拔为吏科庶吉士。第二年提升为户部侍郎。当时担任诸司者，一般是进士和太学生，但经常有不法者。太祖御制《大诰》，举通政使蔡蠧、左通政茹王常、工部侍郎秦逵及杨靖赞扬说：“这也是进士、太学生，但都能尽职而令我满意。”他受到了如此的称赞。
二十二年(1389)晋升为尚书。第二年五月，诏令在京为官三年的都能升迁，并成为规定。太祖要刑部尚书赵勉和杨靖交换官职，谕曰：“百姓犯法，就如饮食一样容易。设法防范，违犯者越多。推恕行仁，或许能感化。从今开始，犯有十恶罪并杀人的一律处死，犯其他罪的都让他们向北边输粟。”又说“：在京城的囚犯，你等应复奏，我亲自审决，尚怕有所失误。在外地的官吏所思量的，又怎么能全面呢？你们应详细上奏，然后派遣官吏审决。”杨靖领旨研办，大多数得以平反。太祖予以嘉奖，并采纳了他的意见。曾抓了一武弁，卫兵搜了他的身，得到一颗大珠，属僚十分惊异。杨靖却慢条斯理地说：“这是假的，怎么能有如此大的珠呢？”于是将珠打碎。太祖听说后，感叹道：“杨靖的这个举动，有四点值得称道。不把它敬献给我以讨得欢喜，这是其一。不穷追投献，这是其二。不奖励门卫，杜绝了小人的侥幸心理，这是其三。千金之珠猝然而至，毫不动心，说明杨靖有过人之智，应变之才，这是其四。”
二十六年(1393)兼任太子宾客，并给予二份俸禄。不久，犯罪被免职。正遇上征讨龙州赵宗寿，诏令杨靖晓谕安南为军队输送军粮。杨靖穿上白衣前往。安南相黎一元以陆运险艰为由，欲不奉行诏令。杨靖反复宣讲谕令，并允许他水运。一元于是输送粮食二万石至沲海江，另造浮桥到达龙州。太祖十分高兴，任命杨靖为左都御史。杨靖公忠而有智略，善于处理繁杂的事务，治狱明察而不事深文。他得到的宠遇最丰厚，同行没有人可与他比。三十年七月因为乡人代改诉状而犯罪，被御史弹劾。太祖大怒，于是赐他死罪。终年三十八岁。
单安仁，字德夫，濠州人。少年就担任府吏。元朝末年，江淮兵荒马乱，安仁召集义兵保卫乡里，元朝廷授予他枢密判官。跟从镇南王孛罗普化镇守扬州。当时群雄四起，安仁感叹道：“这些人都是为渊驱鱼，为虫驱雀罢了，王者兴起，不会是这样的。”镇南王被长枪军赶跑，安仁没有归属，听说太祖平定集庆，就说“：这才是王者。”率众前去归附。太祖十分高兴，就命令他率军镇守镇江。安仁严格整顿军队，敌人不敢进犯。移守常州，他的儿子叛降了张士诚，太祖深知安仁忠谨，也没怀疑他。一段时间后，晋升为浙江副使。有悍帅横敛百姓，名目叫寨粮，安仁绳之于法。晋升为按察使，征召为中书左司郎中，辅佐李善长裁断政事。调任瑞州守御千户，入宫任将作卿。
洪武元年(1368)，提升为工部尚书，仍统领将作事务。安仁精敏，足智多谋，诸多营造工程，大小及程式，十分符合太祖的心意。过了一年改任工部尚书，因年老请求还乡。赐给三千亩田，七十头牛，每年供给尚书俸禄的一半。六年，任山东参政，恳切推辞，得到许可。回老家闲居，曾上奏请求疏通仪真南坝至朴树湾的水道，以便利官民运输，疏通运河江都深港以防止淤塞，迁移瓜洲粮仓至扬子桥西，以免受大江风潮的侵害。太祖认为他的建议很好。再次授予他兵部尚书。他辞官不做。最初，尚书官阶是正三品。十三年，中书省撤消后，尚书升为正二品，但安仁辞官在此之前。太祖念及安仁的功勋，二十年，特授予他为资善大夫。当年十二月，安仁去世，终年八十五岁。
薛祥，字彦祥，无为人。跟从俞通海前来归附，渡长江时担任水寨管军镇抚，多次从征有功。洪武元年(1368)，转漕至河南。半夜抵达蔡河，强盗突然到来。薛祥不为所动，好语劝散了强盗。太祖听说后十分高兴。派他带兵，任职十分卖力，授予京畿都漕运使，负责淮安。浚河修筑堤坝，自扬州到济南长达数百里，徭役分担十分均平，百姓没有什么怨言。有功劳的立即上奏，授予官职。元朝都城被攻下，官民纷纷南迁，途经淮安，薛祥多方给予方便。山阳、海州民乱，驸马都尉黄琛前去平定，牵连了许多人。薛祥会同审讯，无罪的就当场释放。薛祥治理淮安八年，百姓都称赞他。到他任期满后回京城时，百姓焚香希望他再来，有的还祭祀他的肖像。
八年(1375)授予工部尚书。当时正在修建凤阳宫殿。皇上坐在殿上，就好像有人持兵器相斗于屋脊上。太师李善长奏说诸工匠用厌镇法，皇上将要把他们全部杀了。薛祥分别清理出因交替而不在工地上的工匠，还有铁石匠也都没有参预，这样幸免一死的有千余人。营造谨身殿时，有关衙门把中匠列为成上匠。太祖对他们这种欺上行为十分愤怒，命令将他们斩首弃市。薛祥在一旁急辩说“：因奏请不如实，竟而杀人，恐怕不符国法吧？”得到命令将用腐刑。薛祥又奏请说“：腐刑，就是废人，还不如鞭杖他们，然后要他们上工。”得到了太祖的许可。第二年把天下的行省改为承宣布政司。以北平为重地，特别授职于薛祥。三年(1371)薛祥的政绩列为第一，因被胡惟庸诽谤营建扰民而犯罪，被贬任嘉兴府知府。胡惟庸被被杀以后，再次被召为工部尚书。太祖说：“谗臣迫害你，你为什么不申诉呢？”回答说“：我不知实情。”第二年犯罪被杖打致死，天下的人为之哀痛。他有儿子四人，被贬至琼州，于是成为了琼山人。
唐铎，字振之，虹人。太祖刚刚起兵时，他就侍奉在太祖的左右。镇守濠州，从定江州，授予西安县丞，召为中书省管勾。洪武元年(1368)，汤和攻克延平，任命唐铎为知府，抚辑新附，使士民都安居乐业。任职三年，召入朝中为殿中侍御史，再次出任绍兴府知府。六年十二月召为刑部尚书。第二年改任太常卿。在为母守丧期间，特许供给半禄。
十四年(1381)，上朝参拜，被任命为兵部尚书。第二年，设置谏院，任命他为谏议大夫。太祖常常和侍臣讨论历代兴衰，说：“使我的子孙如成、康，辅弼如周、召，则可祈天永命。”唐铎因此进言说：“自小就打好根基，选左右大臣为辅导，国家就可以万年福贵。”太祖又对唐铎说“：人有公私，故言有邪正。正言务规谏，邪言务谤谀。”唐铎说：“诽谤接近忠良，阿谀接近厚爱，只要不被他们所迷惑，谗佞之人自然远去。”不久，晋升为监察御史，请求挑选贤能的京官深入偏僻的郡县，访求贤才，体察官吏，挑选阅历丰富、老练、名望很高的人，委以布政、按察之重任。得到皇上的批准。又提升为右副都御史，历任刑、兵二部尚书。二十二年，设置詹事院，命令吏部说“：辅导太子，一定要挑选端重之士，三代保傅，礼甚尊严。兵部尚书唐铎，谨厚有德量，以为詹事，仍享受尚书俸禄。”唐铎请求豫教故里。当年，辞官。
二十六年(1393)，为太子宾客，进而任太子少保。二十八年，龙州土官赵宗寿因上奏郑国公常茂死事不实，被召而又不至，皇上大怒，命杨文统率大军前去征讨，而命唐铎前去招谕。唐铎到了以后，证实了常茂已病死，宗寿也已伏罪来朝。于是诏令杨文移兵征讨奉议诸州叛蛮，任命唐铎参议军事。过了一个月，诸蛮得以平定。唐铎相度形势，请求在奉议卫及向武、河池、怀集、武仙、贺县诸处设置守御千户所，派官军镇守。都得到许可。
唐铎为人总似长者，性格缜密，不妄加取予。太祖以老朋友对待他，曾说：“唐铎从朋友到臣子至今已有三十余年了，他与人交往，不会翻脸，也绝对不会恶言伤人。”又说：“都御史詹徽刚断，疾恶如仇，胥吏不得肆意贪污，但满朝都诽谤他。唐铎重厚，又说他懦而无为。人心不古，怎么会到今天这一步啊！”后来詹徽犯罪被杀，但唐铎得到的恩遇一直没有改变。三十年(1397)七月死于京师，终年六十九岁。太祖赠送礼物十分丰厚，命官府护送他归葬故里。
开济，字来学，洛阳人。元末是察罕帖木儿的掌管书记。洪武初年，受人举荐，授予河南府训导，入宫为国子助教。因疾免职回乡。十五年(1382)七月，御史大夫安然举荐开济有治理之才，召任试刑部尚书，一年之后，正式任命。
开济以综核为己任，奏请天下诸司设置文簿，每天都记载做过的事情，考核得失，又令各部勘合文移，设立程限，评定功罪。又说，军民以细故犯罪的，应立即谪贬。数月之间，堆集的文牍一扫而清。太祖十分赞赏他的能力。都御史赵仁建议，从前以“贤良方正”、“孝弟力田”诸科所取之士列置郡县，大多不能胜任，应考核他们，决定去留。开济分别予以商议，以“经明行修”为一科，“工习文词”为一科“，通晓书义”为一科“，人品俊秀”为一科“，练达治理”为一科“，言有条理”为一科，六科完备的为上，三科以上的为中，不及三科的为下。得到许可。
开济敏慧有才辩，凡国家经制、田赋、狱讼、工役、河渠等事务，众人没有能裁定的，开济一算画，就形成了条理品式，并且可为世代遵守。因此太祖十分信任他，多次召他为顾问，并兼理其他部的一些事务。人们因此顾忌，诽谤之声四起。然而开济深沉尖刻，善于以律法伤人。曾奉命制定诈伪律。皇上说“：制定严密的法律约束百姓，可以吗？”又设籍，称为“寅戌之书”，以衡量僚属出入。太祖斥责说：“古人以卯西为常，今使趋事者朝寅暮戌，奉父母，会妻子，几何时耶？”又张榜告诫其僚属，请求张贴在文华殿。太祖说：“告诫僚属的言论，欲张贴在殿廷，难道是人臣之礼吗？”开济谢罪。
不久令郎中仇衍妄图开脱死囚，被狱官发觉。开济和侍郎王希哲、主事王叔征把狱官捉拿击毙了。当年十二月，御史陶篨仲等揭发了此事。就说“：开济奏时事，把奏章藏在怀中，有时隐藏着而不做声，察看皇上意思，模棱两可，奸狡莫测。把他的外甥女奴役为婢。他妹妹早已守寡，赶走了姑姑并吞并了她的家财。”太祖大怒，把开济投入了狱中，并把王希哲、仇衍等人斩首。